冷凍離心機的控制系統根據工藝和設備管理要求，由就地控制室(現場操作臺和控制柜)及總控室上位機兩部分組成。就地控制室在離心機現場，其中現場操作屏安裝有所用的操作按鈕、指示燈、蜂鳴器、轉速顯示和主電機電流顯示儀表等元件設備;控制柜內裝有可編程控制器(PLC)、交流變頻器、程控穩流穩壓電源、直流電源、繼電器、信號隔離轉換器等。總控制室上位機與就地控制室間由通訊電纜聯接。
冷凍離心機的監控系統軟件編制：
1.根據使用廠家要求，離心機的控制方式分為手動(步進)、單循環、全自動循環。手動單循環是在調試或者其它試車情況下使用，正常生產時使用全自動方式。
2.編程采用編程專業軟件包，基于個人計算機，適用于PLC的程序編制和監控，通過計算機串行接口與PLC編程口相連，軟件中同時使用了語句表，梯形圖等。不同的編程方法有不同的特點。
3.根據故障對設備的損壞程度，將故障分為一般故障和重大故障：
一般故障如氮氣的上下限，各類閥的開關不到位，離心機的前后軸溫度的上限、振動上限、轉速上限等。
重要故障如急停，門蓋未閉、氮氣的上上限、氮氣的下下限、前后軸溫度的上上限、振動的上上限、轉速的上上限等。
一般故障發生時，執行程序處于暫停狀態，所有控制閥的輸出信號停止輸出，離心機的速度也慢慢降至待機速度，等到故障處理完畢，在人機界面上可選擇工藝步驟重要故障發生時，離心機跳機，處于自由停車狀態;工藝步驟處于停止狀態，所有控制閥的輸出信號停止輸出。等到設備維修人員排除故障后，方可重新開機。
重要故障發生時，離心機跳機，處于自由停車狀態;工藝步驟處于停止狀態，所有控制閥的輸出信號停止輸出。等到設備維修人員排除故障后，方可重新開機。
冷凍離心機的使用注意事項：
1.冷凍離心機在預冷狀態時，離心機蓋必須關閉，離心結束后取出轉頭要倒置于實驗臺上，擦干腔內余水，離心機蓋處于打開狀態。
2.轉頭在預冷時轉頭蓋可擺放在冷凍離心機的平臺上，或擺放在實驗臺上，千萬不可不擰緊浮放在轉頭上，因為一旦誤啟動，轉頭蓋就會飛出，造成事故。
3.轉頭蓋在擰緊后一定要用手指觸摸轉頭與轉蓋之間有無縫隙，如有縫隙要擰開重新擰緊，直至確認無縫隙方可啟動冷凍離心機。
4.離心過程中，操作人員不得離開冷凍離心機室，一旦發生異常情況操作人員不能關電源(POWER)，要按STOP。在預冷前要填寫好冷凍離心機使用記錄。
5.不得使用偽劣的離心管，不得使用老化、變形、有裂紋的離心管。
6.在節假日和晚間最后一個使用冷凍離心機例行安全檢查后方能離去。